Phim Nữ Thần Rắn 2 – Nakee 2 kể về câu chuyện về nhân vật Sroi Ubon, một cô gái trẻ sinh ra và lớn lên ở ngôi làng Don Mai Pah, tỉnh Ubon Ratchathani ở vùng đông bắc Thái Lan. Ngay từ khi còn nhỏ, cô đã có niềm tin vào Jao Mae Nakee, giúp đỡ bà của mình trong việc bán hoa cho những người đến thờ phung Nakee, và hàng ngày chăm sóc ngôi đền đá linh thiêng này. Do đó, Sroi có tình cảm đặc biệt và gắn bó sâu sắc với Nakee.
Tuy nhiên, kể từ khi đội trưởng cảnh sát Pongprap được điều đến đây làm việc thì đã xuất hiện nhiều tội ác bí ẩn. Trong đó, có nhiều trường không thể giải thích vì có quá ít manh mối và chứng cứ. Trong khi dân làng hoang man, lo sợ và tin rằng Nakee đã làm tất cả mọi chuyện, đổ mọi lỗi lầm cho Sroi thì Pongprap không bao giờ nghi ngờ gì về Sroi, anh chắc chắn rằng có một ai đó đang đứng đằng sau điều khiển mọi chuyện. Vì vậy, anh quyết tìm ra sự thật về tất cả những tội ác bí ẩn ở làng Don Mai Pah.